鱼苗下塘前7——15天，要选择晴天进行消毒，以杀死鱼塘中的病菌和敌害。常用消毒药物有生石灰、茶枯、巴豆、漂白粉等。　　

　　①生石灰消毒：生石灰遇水后会产生强碱故有很强的灭菌及杀死敌害能力。在苗种放养前半月左右，选择晴天采用生石灰消毒。消毒时，鱼塘需留水7––10厘米，以便撒入的生石灰能均匀分布。生石灰用量，一般每亩60––75公斤，淤泥少的鱼塘则用50––60公斤。

　　用法：先在池边周围挖若干小潭，然后将生石灰放入潭内吸水深化，不待冷却即用木锹向周围泼洒，务必使灰浆均匀泼遍全地。如果鱼塘两岸较狭能直接洒到的，可将生石灰在木桶中化浆后直接泼洒地中。待经数小时后，用长柄泥耙将塘底淤泥和石灰浆调和一下，使塘泥与石灰均匀混合，增加消毒除害的效果。排水不便的鱼塘，进行带水消毒，每亩鱼塘水深1米时，约用生石灰125––150公斤。　　

　　②漂白粉消毒：漂白粉一般含氯量在30%左右，经潮湿分解放出次氯酸和碱性氯化钙。次氯酸释放出的新生态氧，有强烈的杀菌作用。

　　用法：每立方米水体用漂白粉20克，将漂白粉加水溶解后，立即遍洒全池。漂白粉在空气中极易挥发和分解，须密封贮藏，隔绝空气。应贮藏于阴凉干燥的地方，以免失效。盛置漂白粉的器皿最好用陶磁缸和木制器皿，不宜用金属器皿。使用时应戴上口罩，在上风处泼洒药剂。　　

　　进行药物消毒时，以生石灰的消毒效果最好，漂白粉效力相似于生石灰，但在肥水中药效会减低，而且消失也快，对急于使用的池塘较为适宜。生石灰作用强烈并彻底，不仅可杀灭池中的野杂小鱼、蛙卵、蝌蚪、螃蟹、蚂蟥、毒苔等水生生物，而且可消灭鱼类的致病细菌、寄生虫；同时还可改良池底土质，提高土壤的肥力，增加水中的矿物元素，起到直接施肥的作用。茶枯次于生石灰，一般可杀死鱼、虾、昆虫，但不能杀灭水生植物如青苔、水绵，对有害的细菌和藻类反而能促进其生长。巴豆只能杀死野杂鱼，对寄生虫、细菌、水生植物均没有杀灭作用。鱼池经过消毒后，即注入新水。为了防止野杂鱼和小虾等进入鱼池，在进水口应装上较密的过滤设备。